Diversas corrientes intelectuales influyeron profundamente en la educación pública de la época moderna. Desde principios del siglo XVI, la influencia del humanismo se dejó sentir en las escuelas eclesiásticas y en las escuelas municipales de latín, a través de las conferencias de sus representantes, como Heinrich Wölfli en Berna y Pierre Falck en Friburgo. Erasmo y sus amigos ejercieron una gran influencia en Basilea. Pierre de la Ramée (1515-1572) revitalizó la enseñanza superior en Berna y en la Suiza occidental. La Reforma y la Reforma Católica condujeron a un renacimiento de las escuelas y a su apertura a sectores de la población que hasta entonces no habían tenido acceso a ellas. Se hizo hincapié en la educación religiosa del pueblo, cuidando cada confesión de mantener la pureza de su fe; enseñando a leer al mayor número posible de personas en las escuelas elementales (alfabetización), se consiguió un mejor conocimiento de la Biblia y del catecismo, leídos o aprendidos de memoria. El biblicismo protestante fomentó el estudio de las lenguas antiguas y la introducción del hebreo como asignatura escolar.
