Una auditoría especial puede definirse como un tipo de auditoría estrictamente definida que se lleva a cabo para investigar un área específica de las actividades de la organización. De hecho, se puede observar que este tipo de auditoría es iniciada principalmente por un tercero, como una agencia gubernamental o la autoridad fiscal. Cada país impone sus normas en este ámbito, aunque también existe la autorregulación en algunos de ellos. En una auditoria de este tipo, puede ser necesario comprobar detalladamente las operaciones o bien puede ser suficiente llevar a cabo pruebas selectivas de ciertas partes de la contabilidad. En este texto se ofrece varios ejemplos de auditoría especial.